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林蠡:龜類是新冠狀病毒潛在中間宿主?文章依據嚴重不足!

2020-3-1 10:27| 發布者: 緣木魚| 查看: 51266| 評論: 0|來自: 水產前沿

摘要: 中國水產頻道原創報道,其實至今為止,全世界在龜鱉類還沒有冠狀病毒報道的先例。龜鱉類不是新型冠狀病毒的中間宿主,劉龍和吳建國團隊的文章結論依據不足而且是草率和不負責任的。
  文/ 仲愷農業工程學院動物科技學院院長、廣東省水產疫病監測與綜合防控共性關鍵技術創新團隊首席科學家、廣東省水生動物衛生協會會長 林蠡

仲愷農業工程學院動物科技學院院長、廣東省水產疫病監測與綜合防控共性關鍵技術創新團隊首席科學家、廣東省水生動物衛生協會會長 林蠡

  中國水產頻道原創報道,2020年2月26日,湖北醫藥學院(Hubei University of Medicine)劉龍課題組聯合暨南大學(Jinan University)吳建國課題組(他們兩人是共同通訊作者)在 J Med Virol《醫學病毒學雜志》上發表論文“Composition and divergence of coronavirus spike proteins and host ACE2 receptors predict potential intermediate hosts of SARS-CoV-2” 中文翻譯是:【冠狀病毒刺突蛋白和宿主血管緊張素轉換酶2(ACE2)受體的組成和分化預測新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)潛在的中間宿主】。

網絡上文章信息截圖如下:
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圖1、網絡上文章信息截圖

下面我剖析一下這篇文章的主要結果:
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  在摘要(Abstract)沒有畫紅線部分主要是講述研究背景和意義。紅線部分是主要結果。紅線部分翻譯如下:在這個研究,我們系統地比較冠狀病毒刺突蛋白和宿主受體血管緊張素轉換酶2(ACE2)結合的結構域。刺突蛋白和宿主受體血管緊張素轉換酶2(ACE2)結合的關鍵氨基酸表明穿山甲、蛇和龜鱉類(西部錦龜、綠海龜、中華鱉)可能是人類SARS-CoV-2病毒的中間宿主。

  文章的結果主要來自下表的冠狀病毒刺突蛋白和宿主受體血管緊張素轉換酶2(ACE2)結合的結構域氨基酸比較:
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圖2、不同動物ACE2蛋白和新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)結合結構域的氨基酸序列比對

  根據上述結果,作者的主要描述見下面紅色部分

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  紅色部分中文翻譯如下:在龜鱉類(西部錦龜、綠海龜、中華鱉)穿山甲和蝙蝠類的這個結構域和理論上可以感染的物種,比如人類、大猩猩和獼猴有5個以上的差異。小鼠和狗的突變多個5個氨基酸,貓和倉鼠只是有3個突變。

  在討論這篇文章結果之前,我們先討論下穿山甲是否為新型冠狀病毒的中間宿主?根據目前學術界的觀點,穿山甲冠狀病毒的全基因組和新型冠狀病毒的全基因組只有90.3%的相似度,穿山甲不是新型冠狀病毒的中間宿主。

  基于上述主要結果,可以得出以下幾點:

  1. 文章作者只是采用采用生物信息學工具去分析網絡下載的序列。結果只是一種預測,沒有必須的實驗結果支撐。如何解讀生物信息結果,需要非常謹慎。

  2. 作者沒有從龜鱉類上分離到任何冠狀病毒。其實至今為止,全世界在龜鱉類還沒有冠狀病毒報道的先例。就算分離到冠狀病毒,作者還要對分離到的病毒株進行全基因組測序,在核苷酸序列上和SARS-CoV-2病毒全基因組有非常高度(99%以上)的相似度,才能下現在的結論。

  3. 病毒感染一個宿主,其生活史為:附著、入侵、脫殼、轉錄、復制、翻譯、組裝和釋放 8個關鍵環節。任何一個環節出問題都會導致病毒感染的失敗。冠狀病毒刺突蛋白和宿主受體血管緊張素轉換酶2(ACE2)結合,只是涉及到病毒的入侵環節。而且作者也承認龜鱉類與人類的血管緊張素轉換酶2(ACE2)和冠狀病毒結合的結構域還存在5個氨基酸的差異。因此,病毒能否進入龜鱉類細胞還是疑問。就算進入細胞,還要龜鱉類細胞支撐病毒的脫殼、轉錄、復制、翻譯、組裝和釋放 6個關鍵環節。此外,病毒復制需要一定的溫度范圍,龜鱉類是變溫動物,人類是恒溫動物。龜鱉類很難在人的正常體溫(36攝氏度)下存活。

  4. 文章作者充分利用穿山甲是中間宿主這個結果來支撐他們的預測。穿山甲是哺乳動物,龜鱉類是爬行動物。在分類上,穿山甲比龜鱉類更加接近人類,現在連穿山甲都不是新型冠狀病毒的中間宿主,龜鱉類就更加不可能了。

  綜上所述,可以看出,龜鱉類不可能是新型冠狀病毒的中間宿主,湖北醫藥學院和暨南大學團隊的結論缺乏基本的科學依據。

  【關鍵字】:龜鱉類   新型冠狀病毒    水產前沿
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