在扇貝養殖過程中如果操作處理不當的話，會人為造成死亡和減產。一般來說造成扇貝網中扇貝死亡的人為因素主要有：

養殖密度大

由于養殖戶片面追求單位面積的產量，多數采用高密度養殖的方法，養殖面積逐年遞增，并不斷向外拓展，養殖水深也由10m向外延伸至20m以上。過去養殖臺架行距5m-6m，現縮小至 2m-3m以上。原養殖區域留用的附屬水域也都加以利用。目前扇貝的養殖方法大多采用垂下式扇貝網籠養殖，水體交換能力差，扇貝及大量附著生物的排泄不能及時擴散，沉積在養殖網周圍的海底，并發生腐爛，產生有害物質，風浪增大時，這些有害物質泛起，毒害扇貝。此外，過高養殖密度致使餌料生物驟減，扇貝因缺乏餌料，抗病能力和抵御環境惡化能力下降，一旦環境不適，患病和死亡率增大。如果死亡的扇貝不及時清理，又可能誘發大批扇貝的死亡。養殖密度過大，還會導致彼此之間為了爭奪空間而相互咬合，最終導致受傷、死亡。

人工操作的影響

人工操作的不當也可能導致貝的死亡。如養殖操作過于簡單化，稚貝運輸、分苗時苗種離水時間過長，養殖過程中不清刷網籠，褪套網不注意氣溫和離水操作，倒籠和分籠時過度的機械損傷等。

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