一般短途運輸活魚，可用塑料彩條布鋪在魚箱內，用水養運。為減少死亡，對不夠靈活、有機械損傷的魚應及時剔除。同時在箱上加蓋尼龍網罩，以防活魚跳出。長途運輸時可在魚箱上鋪少量水草。夏季每隔４小時換水１次。或采用安眠法運輸，即在水中注入二氧化碳和氧氣各５０％，活魚就會處于昏迷狀態，然后將“醉魚”從水中撈出裝入塑料袋或魚箱、魚盒中運輸，這樣可使魚安眠近４０個小時，到達目的地后，再將魚放進清水中，“醉魚”在幾分鐘內便可清醒。
短途運輸用濕透水的蒲包包裝，并應避免受壓和曝曬。長途運輸宜用嚴實的簍子存裝，先在簍底鋪層泥，并撒些芝麻和打散的雞蛋，而后將活蟹一只只擺平疊放，再加蓋保蔭。若在蟹群中放些吸水的海綿和泡沫塑料，則效果更好，可保蟹存活４－５天。因蟹既怕熱又怕風，夏季要注意遮陽，冬天要用蒲包或麻袋擋風。
短途運輸，可用水充分淋濕魚體后放入濕蒲包內并扎口，再放進加蓋的魚簍中，每簍裝１０公斤左右。長途運輸要用魚箱盛水裝載，每天換清水１－２次。由于在運輸中密度大、溶氧低，加之鱔魚喜相互纏繞，移動性差，易造成容器內部發熱、缺氧。因此，要在每個鱔魚箱中混入１公斤泥鰍，利用泥鰍的上游下竄習性來避免鱔魚纏繞，增加溶氧，提高鱔魚運輸成活率。
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