一：底質
在水產養殖中，養殖的池塘經過一段時間飼養大量投餌，剩余殘餌，動物糞便沉積池底，使底質惡化，產生有害物質，抑制水產養殖動物生長發育，因此在養殖過程中注意觀察底質，保持池塘生態系統平衡，水質各項指標穩定并符合漁業用水標準，營造一個穩定優良的水環境，促進水產養殖動物生長發育的過程。
二：池塘底質的污染來源
1、外源輸入：主要是飼料、排泄物以及藥物的輸入，是精養魚塘底質有機質的主要來源。輸入的飼料中N占90-98%，輸出魚類的利用率僅占20-27%，其余占N的54-57%全部沉積于池塘底部；而輸入的飼料中P占97-98%，輸出魚類P的利用率僅占8-24%，其余占P的72-89%全部沉積于池塘底部。說明養殖動物對投入飼料中的氮、磷吸收利用占的比例較少，而沉積于池塘底部占的比例較大，導致浪費和污染；
2、內源輸入：內源輸入主要是通過池塘內部系統浮游動植物以及藻類尸體的沉降。由于養殖時間不斷增加，池塘水體環境污染日益惡化，水體富集營養化導致養殖池塘中大量的細菌、病毒等有害微生物開始迅速繁殖，為池塘疾病的爆發構成巨大威脅；
3、本底污染：原有池塘本身的污染。
